(一)主計行政資訊業務
「主計人員人事應用系統」提供本總處人事處及各主計機構辦理主計人員人事相關作業，並與人事行政總處主計人員管理資訊系統(主計人員版WebHR)進行介接，且整合「主計人員訓練管理資訊系統」，提升主計人力資源管理效益。配合行政院推動全面簽署內部控制聲明書，本總處建置「內部控制聲明書申報系統」，以協助各機關運用資訊系統提升作業效率並落實逐級督導。
(二)經費核銷資訊業務
考量外部原始憑證數位化程度於近年來逐步成熟（如：財政部電子發票整合服務平台、各機關內部行政系統），本總處爰於106年起建置共用性「經費結報系統」，逐步發展專項結報項目，供各機關辦理經費結報電子化作業。
(三)一般行政資訊業務
本總處現有「公文及檔案管理系統」、「差勤系統」、「財物管理系統」、「主計知識管理平台」，持續提供本總處同仁穩定之行政資訊服務。